报告题目: EGPS 1.0: Comprehensive software for multi-omic and evolutionary analyses

报告人: 李海鹏研究员

        中科院计算生物学重点实验室

时  间: 9月18日（周三）16：00

地  点: 岳阳路319号信息中心明德厅

摘  要：

   组学数据爆发性增长，而对数据的高效挖掘和深度分析却成为生物学家面临的难题。我们开发了针对生物进化和多组学分析的综合软件eGPS（evolutionary Genotype-Phenotype Systems），极大方便了相关分析。eGPS软件包括单机版本和云计算版本，可在不同平台下运行，且利于开发，易于应用。云计算版本将基因组分析、群体数据分析、进化数据分析、网络分析以及图形可视化这五部分的分析有机整合起来，实现远程云计算功能，方便用户在缺乏计算资源的情况下快速获得运算结果，并最终以图形、图表等形式直观展示。单机版本可以在无须上传数据的情况下，帮助用户分析基因组学、转录组学和蛋白质组学的数据。同时eGPS Desktop还拥有完善的进化分析流程。比如可以直接从基因组序列比对建立物种树。在eGPS Cloud和其他开放式在线资源的支持下，eGPS Desktop提供了一键点击从候选基因到基因树的分析流程。相关程序可从http://www.egps-software.org/免费获取。 

个人简介：

     李海鹏，进化基因组学研究组PI，从事理论群体遗传学、生物信息学、进化生物学的研究。

     欢迎大家参加！